8th International Conference on cGMP

cGMP2017 Conference

We presented the communication «A computational approach to understand the mechanisms of pharmacological modulation of guanylate cyclases» (as a poster) to the 8th International Conference on cGMP, at Bamberg (Germany).

Poster UVIC cGMP2017

Publicado en Scientific meetings | Deja un comentario

Manuscript accepted in Scientific Reports

Our study Proteoliposomal formulations of an HIV-1 gp41-based miniprotein elicit a lipid-dependent immunodominant response overlapping the 2F5 binding motife has been accepted for publication in Scientific Reports. This work is the result of a collaborative project with the AIDS Research Institute (IrsiCaixa-HIVACAT, Barcelona). Permanent link to this publication: Link.

Publicado en Scientific publications | Deja un comentario

Vuit investigadors vinculats a la UVic-UCC, entre els primers 5.000 científics d’institucions espanyoles amb més citacions a Google Scholar

Dos membres del nostre grup de recerca (The Computational Biochemistry and Biophysics Lab) entre els vuit primers investigadors per número de citacions segons publica avui la UVIC-UCC:

«Diversos professors i investigadors de la Universitat de Vic – Universitat Central de Catalunya, o vinculats a la institució, formen part del quart Rànquing de Científics a les institucions espanyoles, que elaboren anualment el projecte ACUMEN i el CSIC (Consell Superior d’Investigacions Científiques) a partir de les citacions aparegudes als perfils públics de Google Scholar, el motor de cerca acadèmic d’aquest cercador. Les dades es corresponen a la segona setmana del desembre de 2016, i el llistat s’elabora en primer lloc a partir de l’índex h de cada investigador, un indicador estadístic que quantifica la seva productivitat científica i l’impacte dels seus articles, i en segon lloc a partir del nombre total de citacions amb què cada signatura compta.  El rànquing, a més, vincula el nom de cada investigador a les institucions que aquest especifica al seu perfil de Google Scholar.

Entre els investigadors vinculats a la UVic-UCC, el més ben posicionat és el director de la càtedra de la Sida i Malalties Relacionades, Bonaventura Clotet (posició 28), amb un índex h de 90 i amb 36.355 referències indexades. Altres membres d’aquesta càtedra també ocupen llocs preferents: Christian Brander (posició 67), Javier Martínez Picado (555), Roger Paredes (849) i Julià Blanco (1.084). El vicerector de Recerca i Professorat, Jordi Villà, es troba al lloc 2.576 del rànquing, seguit per Lluís Agulló al 3.215 i per la professora d’investigació ICREA Sandra Brucet al 3.969. Més avall encara trobem la catedràtica i doctora en Matemàtiques Malu Calle, a la posició 7.607, la directora de la càtedra d’Agroecologia i Sistemes Alimentaris Marta Guadalupe Rivera, al lloc 8.010, i el professor i investigador de la línia de recerca en Ecologia Aquàtica del CT Beta- Xarxa TECNIO, Lluís Benejam, al 8.311.

El rànquing recull un total de 23.578 noms d’entre els 37.819 perfils científics existents al cercador, i l’encapçala el cardiòleg Valentí Fuster, director general del Centre Nacional d’Investigacions Cardiovasculars, que té un índex h de 166 i compta amb 164.096 citacions.»

Publicado en CBBL, UVIC-UCC | Deja un comentario

IV Bioinformatics and Genomics Symposium

Martin Floor presenta la comunicació «Empirical Valence Bond Simulations of the AZ28 Catalytic Antibody for the Oxy-Cope Rearrangement» (format pòster) a la IV Jornada de Bioinformàtica i Genòmica – Bioinformatics Barcelona.

Publicado en Scientific meetings | Deja un comentario

HIV Research for Prevention Meeting 2016

Luis Manuel Molinos-Albert & Julià Blanco (AIDS Research Institute, IrsiCaixa-HIVACAT, Barcelona) presented a communication (as a poster) to the HIV Research for Prevention Meeting 2016: AIDS Vaccine, Microbicide and ARV-based Prevention Science (HIVR4P), Chicago (USA). This communication («Proteoliposomal formulations of an HIV-1 gp41-based miniprotein elicit a lipid-dependent immunodominant response overlapping the 2F5 binding motif») shows the preliminary results obtained within a collaborative project between the Biofisika Institute (UPV/EHU, CSIC), the AIDS Research Institut and our lab at the Universitat de Vic – Universitat Central de Catalunya (UVIC-UCC).

Publicado en Scientific meetings | Deja un comentario

Manuscript accepted in Proteins

Our study Computational exploration of the binding mode of heme-dependent stimulators into the active catalytic domain of soluble guanylate cyclase has been accepted for publication in Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. This work was started at the Laboratory of Experimental Cardiology (VHIR, Barcelona). Permanent link to this publication: Link.

Image: Docking positions of the activator YC-1 (red points) on soluble guanylate cyclase (the alpha chain of the enzyme and GTP are displayed by surface representation).
Publicado en Scientific publications | Deja un comentario

Our lab granted with 350,000 computational hours

Our project BCV-2016-2-0005 Lipid-dependent binding of neutralizing and
nonneutralizing antibodies to the membrane-proximal external
region of HIV gp41
has been granted with 350,000 computational hours by The Red Española de Supercomputación (RES).

Publicado en CBBL | Deja un comentario

10th RES Users’ Conference

Jordi Villà presenta la comunicació «Is solvation/desolvation enough to unravel protein interactions? Examples on HIV-1 gp41-based miniprotein antibody eliciting and sGC ligand binding» (com comunicació oral) a la 10th RES Users’ Conference (RES, Red Española de Supercomputación).

Publicado en Scientific meetings | Deja un comentario

XXXII XRQTC annual meeting

Presentem la comunicació «Modulation of the immune receptors CD300f and CD200R as a novel therapeutic strategy for acute CNS damage» (format pòster) a la XXXII XRQTC annual meeting (XRQTC, Xarxa de Referència en Química Teòrica i Computacional).

Publicado en Scientific meetings | Deja un comentario

6th International Workshop on Higher Education

Presentem la comunicació «Modulation of the immune receptors CD300f and CD200R as a novel therapeutic strategy for acute CNS damage» (comunicació oral) a la 6th International Workshop on Higher Education 2016 dintre del Workshop in Translational Bioinformatics, organitzada per la Universitat de Vic.

Publicado en Scientific meetings | Deja un comentario